岛开始，到1930年雾社起义。

开篇为日军侵略岛上，老将刘永福等人奋力抗击侵略。

1930年，北白川宫能久亲王被杀，因而举行台湾神社祭，雾社地区则照例举行联合运动会。

赛德克族兵分三路，一路由莫那·鲁道率人埋伏在学校，另一路则由首领莫那次子巴索到马坡山袭击日本警察，第三路由莫那长子率领攻击马赫坡社的警察住所。

当日早上，赛德克勇士提前埋伏，在首领莫那·鲁道的号令下，134名日本人被杀死。

长子和次子都获得成功，他们之后又分别袭击各个警察所，获得了大量的枪械弹药。

但是也引来了日本的报复，来自台中和花莲的两地日军兵分两路扑向雾社，大战拉开序幕。

第二部则是战争的核心部分，日军警三千余人挺进雾社，赛德克族首领莫那率领起义军和日本人浴血奋战。

这部电影在国际上和（目前）国内好评不断，但实际上它也有诸多问题。关于导演魏德圣是否媚日的问题，一直争议不断。

电影在表现仇恨的同时，屁股却不自觉地歪了。电影虽然表现了日本人的残暴，但更像是以某种角度宣扬文明和野蛮的争斗。

电影上半部讲述了赛德克人伏击日本人的「深堀大尉事件」—一勘探铁路的日本人深堀大尉等人被杀，给人一种赛德克人挑衅在先的感觉。

不仅如此，电影还塑造了一个对本地友好的日本人小岛源治形象，小岛源治因为家人被杀开始带队攻击赛德克人。电影将殖民者和被殖民者的矛盾，描述为仇杀。

在影片结束的时刻，竟然安排日军司令镰田弥彦感叹：「三百名战士抵抗数千名大军，不战死便自尽！为何我会在这遥远的台湾山区见到我们已经消失百年的武士精神？是这里的樱花开得太红艳了吗？」」

通过感叹表达日军司令镰田弥彦和莫那虽然作为对手，但仍然惺惺相惜。

这就导致影片最后传达的并不是反抗，而是战争与和解。他妈的，人家把你祖宗杀了一通，你说应该和解，不是贱吗？

实际历史上，被镰田弥彦惺惺相惜的莫那结局惨不忍睹，1934年莫那尸体被发现，日本人将其暴晒之后，拉到「台北帝国大学」